Единственные, вредные микроорганизмы, найденные в торфе — нематоды, но благодаря опытам было установлено, что при добавлении веществ, содержащих известь и намного увеличивающих таким образом рН, количество нематод снижалось до приемлемого уровня. Можно предположить, что большая часть нематод не выживает при сильном изменении рН в окружающей их среде.

Заражение покровной почвы может произойти:

Перед доставкой смеси или ее составляющих на предприятие, пол тщательно моют и дезинфицируют формальдегидами или другими сильнодействующими средствами.

Если есть сомнения в стерильности сырьевых материалов для покровной смеси или если они длительное время хранятся на предприятии, необходима их обязательная дезинфекция непосредственно перед использованием.

Дезинфицировать покровный материал можно двумя способами: термическим (пропариванием) или химическим.

При термическом способе рекомендуют обрабатывать покровную смесь паром низкого давления при температуре 60 — 65°С в течение 6 часов. Считается, что при данной температуре и продолжительности пропаривания сохраняется полезная микрофлора и конкуренты паразитирующих микроорганизмов.

При химическом способе покровную смесь обрабатывают 2% раствором формалина. Требуется 1 литр формалина (40% раствор формальдегида) на 1м³ торфа. Дезинфекция должна проходить при температуре не менее 16°С, так как при более низких температурах формалин не испаряется и, следовательно, не эффективен.

До нанесения на компост приготовленную заранее покровную почву следует хранить под пленкой. При хранении покровной смеси или заготовленного торфа очень важно не допускать контакта материала с землей, попадания в него остатков компоста, отходов грибоводства. Оптимальный вариант — хранить смесь и торф в отдельных чистых помещениях на бетонированном полу.

При использовании «чистых» материалов, т.е. свободных от вредителей и заболеваний, профилактическую дезинфекцию можно проводить после нанесения покровной смеси на гряды. Такие обработки не повлияют на состояние компоста, но дезинфицируют покровный слой. Сразу после нанесения можно дать полив 1 л/м² 2% раствором формалина (2л 40% формалина разводят в 100л воды и используют на 100м² поверхности покровной почвы) очень важно, чтобы раствор попал на все части гряды. На следующий день в покровную почву вносят инсектицид — димилин из расчета 4г/м².